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進化（粵拼：zeon3 faa3；英文：evolution；動詞：to evolve），粵文又有叫演化或者天演，喺生物學上係指一個族群嘅生物嘅可遺傳特徵一代一代噉演變嘅過程，而進化嘅 ...
進化
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達爾文雀（Darwin'sfinches）喺加拉帕戈斯群島唔同島進化出唔同形狀嘅啄，適應唔同島嘅環境。
唔同品種嘅蟹嘅䚗形狀都唔同，而呢種差異源於佢哋需要適應喺唔同環境嗰度生存。
進化（粵拼：zeon3faa3；英文：evolution；動詞：toevolve），粵文又有叫演化或者天演，喺生物學上係指一個族群嘅生物嘅可遺傳特徵一代一代噉演變嘅過程，而進化嘅操作定義（喺實際科研度用嘅定義）係「一個族群內部各基因嘅出現頻率隨住時間而改變嘅過程」[1][2]。
進化論基於遺傳學：所有物種（包括人）都有DNA，呢啲DNA係由基因（gene）組成，而多數物種都或多或少有個體差異－就算係同種嘅生物，隻隻身上帶嘅基因都同同類個體身上嘅有啲唔同，而呢點引致每個個體喺特徵上都有啲唔同；根據物競天擇（naturalselection），因為個體差異，一個族群嘅個體當中可能有啲比較擅長生存同繁殖，生存同繁殖能力勁嘅個體會更加大機會能夠將自己嘅基因傳俾下一代[註1]，所以一個族群嘅基因代代都會有些少唔同咗樣；除咗噉，繁殖嘅細胞分裂等嘅過程之中仲會有突變等嘅現象。
因為呢啲緣故，經過幾百萬年嘅時間，一個族群變變吓就會變到同之前完全唔同咗樣，而呢群新嘅生物嘅DNA帶嘅基因同之前嘅好唔同，差異可能大到算係一個新嘅物種[3][4]。
進化同生物多樣性（biodiversity）好有拏褦，新物種出現主要係靠進化引起嘅：例如有個族群，佢哋因為氣候變化等嘅原因搞到佢哋原本住嘅地方唔再啱佢哋住，於是佢哋就遷徙去第啲地方，可能喺過程入面分開咗做兩組，一組遷徙去地方A，另一組遷徙去地方B，而呢兩個地方嘅環境好唔同，一個凍啲一個熱啲，但兩個都啱嗰種生物住；長遠嚟講，喺凍地區住嗰組會進化出有利喺寒冷環境生存嘅特徵（例如係皮下脂肪變厚），而喺熱地區住嗰組會進化出有利喺炎熱環境生存嘅特徵（例如係皮下脂肪變薄）。
十萬年後，兩組變到好唔同[註2]－變咗做兩個唔同嘅物種，不過佢哋仲有個共同祖先[5][6]。
地球上面次次有親啲族群內部分開搬去唔同環境嗰度住嗰陣，個族群嘅各組就會慢慢噉適應各自嘅新環境而變樣－令地球有豐富嘅生物多樣性[7]。
對進化嘅研究好有用：喺實際應用方面，科學上對進化嘅了解經已俾人應用喺農業同醫學等嘅領域嗰度，例如了解細菌嘅進化對於醫藥研究者整抗生素嚟講好緊要[8]；而且進化嘅相關概念仲喺人工智能（AI）上有用，例如進化演算法就運用咗物競天擇嘅原理做機械學習，用「一代一代淘汰表現差嘅模型」嘅方法得出表現優良嘅模型[9][10]。
目錄
1詞源
2基本概念
2.1遺傳
2.2基因組
2.2.1構造
2.2.2定義進化
2.2.3微同宏進化
2.3有性繁殖
2.3.1基因多樣性
3機制
3.1物競天擇
3.1.1進化適應性
3.1.2運算模擬
3.2人工選擇
3.3基因突變
3.4基因流動
3.5基因漂變
4效果
4.1適應
4.1.1痕跡器官
4.1.2「退化」
4.2物種形成
4.2.1物種概念
4.2.2形成機制
4.2.3概念衝擊
4.3絕種
5證據
5.1微進化嘅證據
5.1.1家紅狐狸
5.2宏進化嘅證據
6進化論史
6.1《物種起源》前
6.2《物種起源》後
7社會反應
7.1宗教觀點
7.2常見批評
7.2.1「理論」
7.2.2種族主義
8註釋
9應用
10睇埋
11文獻
11.1入門書
11.2進階書
12攷
13拎
詞源
達爾文嘅相，1860年左右影嘅；佢嘅物競天擇理論改革咗成個科學界。
英文入面嘅evolution一詞係嚟自拉丁文嘅evolvere，後者嘅意思本嚟係「將一個卷埋咗嘅嘢打開」，而家吓生物學上用呢個詞係指「喺地球歷史上，唔同類嘅生物點樣由早期嘅形式發展出嚟」嘅一種自然現象。
呢個詞喺廿一世紀初嘅英文入面亦有歧義嘅問題：喺日常英文用語裏面，evolution呢個詞有時俾人用嚟指「發展」或者「進步」等嘅意思，又或者係喺某啲大眾媒體嗰度指一啲「有啲似生物學上嘅進化，但又唔係生物學上嘅進化嘅嘢」。
因為噉，家陣啲生物學家喺做親乜嘢有關進化嘅學術討論嗰陣，好多時都會清楚噉講到明佢哋傾緊嘅係生物進化（biologicalevolution）－指一個族群嘅生物隨住世代而出現遺傳上嘅改變嘅一種自然現象[11]。
對進化論嘅發展貢獻重大嘅達爾文都有用evolve呢隻字：達爾文喺佢本名著《物種起源》（OntheOriginofSpecies）嘅1859年第一版係用evolved呢隻字結尾嘅；而雖然達爾文打後又有用
「經過改變嘅繼承」（descentwithmodification）、
「改變過程」（processofmodification）同埋
「物種改變嘅原理」（doctrineofthemodificationofspecies）
等嘅字眼嚟形容生物進化嘅概念，不過到咗《物種起源》最後嘅1876年第六版，達爾文用咗evolution呢隻字好多次，仲直接嗌佢個理論做theoryofevolution（進化論），奠定咗evolution呢隻字嘅使用[12][13]。
喺粵文當中嘅「進化」一詞被指係由日本嘅和製漢字嗰度借過嚟、跟手由大中華地區嘅學者普及嘅：《物種起源》第一本中文版由馬君武翻譯，同早期少少嘅日文版一樣用而家用緊嘅「進化」一詞；而喺廿一世紀初，臺灣以外嘅大中華地區普遍都係用緊「進化」呢兩個漢字表示evolution嘅意思－喺廣東話入面，呢兩個字係讀做「粵拼：zeon3faa3」嘅[14]。
而天演（粵拼：tin1jin2）呢個少人用啲嘅詞就係由嚴復譯嗰本《天演論》嗰度走出嚟嘅[15]。
基本概念
呢兩仔爺對耳仔一個板。
睇埋：遺傳學同埋進化生物學
遺傳
內文：遺傳
廿一世紀進化論最基本嘅概念係遺傳（heredity），即係父母將自己嘅特徵傳俾仔女嘅過程。
由日常生活嘅觀察可以得知以下嘅事實[16][17]：
人與人之間喺各種特徵－包括頭髮同眼珠嘅色水以至身高同體能等－上有差異[18]；
人喺特徵傾向會似自己嘅父母（遺傳），但又好少可會同父母完全一個板[19][20]；
有一啲特徵－例如係疤痕噉－係無論如何都唔能夠由父母直接傳俾仔女嘅；
上述嘅現象喺第啲動物以至植物身上都可以觀察得到。
由呢啲簡單嘅觀察嗰度，可以作出以下嘅假說：是但搵任何一隻生物，佢會由父母身上繼承一啲嘢（呢啲嘢就係所謂嘅基因型；genotype），呢啲嘢會對佢最後嘅整體特徵（表現型；phenotype）有深遠嘅影響，但後天得到嘅特徵（例如疤痕）似乎多數都唔會影響返基因型轉頭，所以唔會直接由父母傳俾仔女。
上述嘅假說喺廿世紀初引起咗學界一個疑問：特徵係點樣由父母傳去仔女嗰度嘅呢？對於呢個問題，生物學界喺1940至1950年代做嘅研究表明，DNA正正就係喺遺傳過程發生嘅媒介，而呢個重大發現定立咗現代遺傳學嘅基礎[21][22]。
基因組
將一條DNA解開嘅抽象圖解；地球嘅生物有由C、G、A、T四個唔同款嘅核苷酸配對組成嘅鹼基對。
內文：基因組
構造
基因組最基本嘅單位係鹼基對（basepair，bp）：一條DNA分子由一排排成雙成對嘅核苷酸（nucleotides；蛋白質嘅一種）組成，後者可以有四個唔同款－C、G、A、T－呢啲款嘅配對同排列會影響到隻生物體內蛋白質嘅產生等嘅生命過程，而呢啲生命過程會影響隻生物嘅特徵（例：肌肉就係由蛋白質組成嘅，所以影響身體嘅蛋白質產生就會影響隻動物嘅肌肉嘅粗幼）；呢啲配對同排列喺隻隻生物入面都唔同，所以物種同物種之間同埋個體同個體之間會喺特徵上有差異[22]。
基因組嘅分層結構如下[註3]：
一條DNA分子上嘅每個基因（gene）都可以由若干對鹼基對組成：隻隻生物嘅基因組入面似乎都有一啲醶基對係冇用嘅，而且一個遺傳特徵可以係由好幾對醶基對一齊決定嘅，一個基因係指一條DNA分子入面某柞一齊做某個功能嘅鹼基對。
如果有某段DNA喺唔同個體入面唔有幾個唔同款，呢啲唔同款就係彼此嘅等位基因（alleles）。
喺一隻生物嘅細胞入面，佢一條條嘅DNA會聚埋一齊形成染色體（chromosomes）嘅結構[23][24]。
一隻生物體內所有嘅染色體加埋嘅總體就係佢嘅基因組（genome）[25]。
舉個例說明，人嘅基因組由23對（46條）染色體組成，呢23對染色體嘅DNA分子上面總共有成超過30億對嘅鹼基對；每一對鹼基對都可以係CG、AT等嘅唔同款，所以有好多個可能嘅組合；是但搵兩個人，佢哋身上嘅鹼基對有99.5%都係一樣嘅[26]；之但係30億嘅0.5%都仲係一個好可觀嘅數字，所以人與人之間有唔細嘅個體同種族差異[27]。
如果一條DNA上面有某一段入面嘅鹼基對會一齊做某個特定功能（例如係決定頭髮嘅色水），噉佢哋就為止「一個基因」。
人類嘅頭髮色水可以有黑、紅、同埋棕幾款，而「黑頭髮嘅基因」同埋「金頭髮嘅基因」就係嗰段DNA嘅等位基因[28]。
定義進化
基因組喺理論思考上可以攞嚟定義進化：隨住時間過去，一班生物嘅基因組會（因為物競天擇等嘅原因）一代一代慢慢噉變，而某啲等位基因可能會完全取代其他等位基因又或者消失－例如有某啲表現型特徵可能好幫到班生物生存同繁殖，令到同佢相關嘅等位基因喺幾代之後就完全支配嗮個物種嘅基因庫（genepool；指個族群身上帶嘅所有基因），又或者因為個特徵太過唔啱生存（例如有個基因會搞到個個體不育）等嘅原因所以好快消失咗。
亦即係話喺呢個過程入面，某啲基因喺個物種嘅基因庫入面出現嘅頻率會慢慢變化，而呢個就係進化嘅操作定義（喺實際搞科研嗰陣用嘅定義）[29]。
數學性啲噉睇，進化嘅過程可以噉想像：喺是但一個時間點，是但搵個基因
g
0
{\displaystyleg_{0}}
，
g
0
{\displaystyleg_{0}}
嘅第
i
{\displaystylei}
個複製品叫
g
0
i
{\displaystyleg_{0i}}
，
g
0
i
{\displaystyleg_{0i}}
傳到去下一代基因庫
x
1
{\displaystylex_{1}}
嗰度嘅機會率會唔等同於另一個基因嘅一個複製品（
g
1
i
{\displaystyleg_{1i}}
），即係
Pr
(
g
0
i
⊂
x
1
)
≠
Pr
(
g
1
i
⊂
x
1
)
{\displaystyle\Pr(g_{0i}\subsetx_{1})\neq\Pr(g_{1i}\subsetx_{1})}
[註4]
例如係好出名嘅樺尺蠖（學名：Bistonbetularia）噉：樺尺蠖係一種飛蛾，本來係白色帶黑斑點嘅，不過喺18世紀工業革命嘅英格蘭，工廠排出大量黑色嘅廢氣，引致樺尺蠖族群嘅色水有所改變－生態學家發現喺工業革命嗰兩個世紀期間，英格蘭樺尺蠖嘅色水變到黑鼆鼆噉色。
根據生物學家嘅研究，呢個現象嘅原因如下－樺尺蠖嘅身體色水係由等位基因話事嘅，隻隻樺尺蠖身上都有決定佢身體色水嘅基因，而「白色帶斑點嘅基因」同埋「黑色嘅基因」係呢個基因嘅等位基因，喺英格蘭樺尺蠖由白色帶斑點變成近乎全黑嘅色水嘅過程當中，「黑色嘅基因」喺呢個族群嘅基因庫入面出現嘅頻率提升咗（黑色身體喺污染得勁嘅環境嗰度起到保護色作用），而「白色帶斑點嘅基因」嘅出現頻率就相應跌咗－喺定義上就係一個進化嘅例子[30]。
上：未經工業革命嘅樺尺蠖樣本；下：工業革命後嘅樺尺蠖樣本[註5]。
微同宏進化
內文：微進化同宏進化
按照呢個定義，進化有得按時間尺度同差異程度分做微進化（microevolution）同埋宏進化（macroevolution）兩種：
想像一個族群，佢哋嘅基因庫會一代一代噉變；喺（例如）10代之後，個基因庫變到有些少唔同咗樣，不過第10代嘅個體同初代個體之間嘅差異仲未算明顯（基因決定特徵），喺生物分類上仲算係同一個物種，呢種喺相對短嘅時間之內發生、未至於令個生物族群完全變成第個物種嘅進化就係所謂嘅微進化，例子有正話提到樺尺蠖族群整體嘅變色過程[31]；
而家想像個族群一路進化落去，喺（例如）過咗10,000代之後，第10,000代嘅個體同初代個體之間有咗極大嘅差異（基因決定特徵），經已算係兩個唔同嘅物種，呢種喺長時間發生、會令個生物族群完全變成第個物種嘅進化就係所謂嘅宏進化，例子有由原始嘅靈長目動物進化成人類嘅過程[32]。
有性繁殖
有性繁殖（左）同無性繁殖（右）嘅分別，M代表公、F代表乸；如果每個個體都生兩個後代，有性繁殖嗰方嘅人口會維持不變，而無性繁殖嗰方嘅人口每代會加倍。
內文：有性繁殖
遺傳係繁殖嘅一部份：
喺原始嘅無性生物當中，基因會直接由母體傳去後代嗰度－好似係細菌靠住一變二、二變四噉嘅分裂，出嘅後代係完全同母體一個餅印嘅。
而喺好似人等嘅有性生物當中，繁殖需要兩個個體（父母）－喺有性繁殖（sexualreproduction）嘅過程，父母嗰度會各自發生細胞分裂（celldivision），雙方都會各自俾一啲基因出嚟，而且呢個過程當中父母俾出嘅基因仲會獨立分別噉洗牌；喺人同其他哺乳類入面，性染色體（allosome）係繁殖嘅關鍵，人男性嘅性染色體係一條X染色體同一條Y染色體，而人女性嘅就係兩條X染色體；喺繁殖嘅過程嗰度，父母會各自將自己嘅其中一條性染色體傳俾個仔女，而呢個過程會決定個細路嘅性別：如果阿爸俾咗自己條Y染色體嘅話就會生仔，而如果佢俾咗自己條X染色體嘅話就會生女。
性染色體將阿爸嘅基因型同阿媽嘅交俾仔女，所以仔女通常都會有啲似阿爸又有啲似阿媽，但唔會同是但一個完全一個餅印，而且呢個過程度仲會有少量嘅洗牌效應，會影響邊個等位基因同邊個等位基因黐埋一齊[33]，令到佢哋嘅仔女身上嘅等位基因會係父母等位基因嘅新組合[34]，所以通常兄弟唔會完全一樣樣，姊妹都唔會完全一樣樣[35]。
基因多樣性
內文：基因多樣性
有性繁殖係一把雙面刃[36][37][38]：
有性繁殖效率相對低：喺兩性有明顯差異嘅物種（例如係人）嗰度，父母淨係得一方可以佗仔；而且靠有性繁殖生下一代嘅個體淨係有得將佢一半嘅基因傳俾下一代，再過多兩代就得返嗰八分之一。
雖然有性繁殖理論上有缺點，真核生物（eukaryotes）同多細胞生物（multicellularorganisms）比較多係行有性繁殖嘅。
廿一世紀生物學界一般認為原因在於有性繁殖令一個族群內部有返咁上下多樣性：就噉複製母體嘅無性繁殖創造出嚟嘅後代同母體一個板；相比之下，有性繁殖當中嘅基因洗牌過程令一個物種嘅基因庫更加多樣化，好多時會令到進化嘅過程更加快[39][40]，而呢一點可能會令個物種更加有能力適應係噉變嘅環境－如果一個物種嘅個體全部都係靠無性繁殖生產後代，個物種繁殖嗰陣就會少咗「唔同個體嘅基因溝埋同重新組合」呢個步驟，噉佢哋嘅基因多樣性就會低得好交關－佢哋啲個體個個都差唔多樣，爭嘅資源都一樣，噉一發生起啲乜嘢天然災害，資源短缺起上嚟就好容易會一嘢冚唪唥死嗮[41][42]。
顯微鏡下睇到、俾研究者上咗色嘅人類染色體
機制
細菌透過物競天擇產生抗藥性嘅抽象圖解；抗藥能力（以色水表示）勁啲嘅個體（一個圓圈代表一個個體）先生存到落嚟，所以得佢哋有得繁殖，佢哋嘅後代都會傾向抗藥能力勁。
進化定義係指一個族群嘅基因庫隨時間演變嘅過程：當某個等位基因喺個物種嘅基因庫入面出現嘅頻率變嗰陣，進化就發生咗。
進化機制（mechanismofevolution）係指引致基因庫一代一代噉改變嘅原因。
根據廿一世紀嘅進化論，進化機制主要有以下呢啲[43]：
物競天擇
內文：物競天擇
物競天擇（naturalselection），粵文又有叫自然選擇，係由達爾文喺佢本名著《物種起源》嗰度提出嘅。
「通過物競天擇進行嘅進化」係指某啲等位基因因為有利於生存同繁殖而變得更加常見嘅過程。
例如身上帶有「抗藥性勁嘅基因」嘅細菌個體比較能夠生存落去同埋繁殖，所以喺下一代入面「抗藥性勁嘅基因」呢個等位基因就變得更加常見。
呢個機制成日俾人話佢係不證自明嘅，因為個機制係三個簡單事實嘅必然結果[44]：
表現型差異：就算係喺一個族群嘅生物入面，個體彼此之間喺形態、生理、行為等各方面（表現型）有所差異；
適應能力差異：唔同嘅表現型特徵對於生存同繁殖嘅影響都唔同，例如「皮下脂肪厚」對於喺凍嘅地方生存有利，而「不育」對繁殖不利；
適應能力嘅遺傳性：呢啲影響適應能力嘅表現型特徵受基因影響，有啲甚至完全由基因話事嘅，所以有得一代傳一代。
喺野外，好多時「生咗出嚟嘅下一代」數量大過「有得生存落去嘅下一代」，而呢啲原因令到同一個物種之間嘅個體會爭生存所需嘅資源（例如係爭嘢食）同埋繁殖嘅機會（例如係爭伴侶）。
喺呢啲競爭嗰度，某啲個體因為先天優勢所以比較大機會爭贏，好似係天生大隻啲聰明啲所以比較擅長搵嘢食，或者天生個樣靚啲所以比較容易搵到伴侶，於是乎呢啲有先天優勢嘅個體同冇咁有優勢嘅比起上嚟，會比較有能力生存同繁殖－將自己身上嘅基因傳去下一代嗰度[45]。
進化適應性
內文：進化適應性
物競天擇帶出咗進化適應性（evolutionaryfitness）呢個概念。
一隻生物嘅進化適應性係指佢生存同繁殖嘅能力，而呢個能力決定佢有幾大機會將自己身上嘅基因傳去下一代。
某隻生物嘅進化適應性係以「比例上有幾多後代帶有嚟自嗰隻生物嘅基因」嚟量度嘅[46]，所以進化適應性唔係齋睇佢可以生到幾多個後代嘅－就算佢生到嘅仔女嘅數量係同類個體嘅十倍，如果嗰啲仔女因為太虛弱或者佢唔識照顧等嘅原因而生存唔到，呢隻生物嘅進化適應性都唔會好高[44][47]。
一個特徵（或者等位基因）嘅進化適應性唔係定死咗唔變嘅。
如果個族群住嘅環境變咗，本嚟係中性或者有害嘅特徵可能會變成有利嘅特徵，反之亦然[48]，例如係頭先講咗嘅樺尺蠖嘅例子噉樣，喺一個乾淨嘅自然環境嗰度，生到成身黑色會令到隻蠖變得更加樣眼，更加容易俾啲獵食者睇到同捉嚟食，但喺工業革命嗰陣，啲工廠噴咗好多污染物出嚟，搞到佢哋住嘅地方好多都變咗黑鼆鼆噉嘅色，喺呢個環境當中，「成身黑色」反而變咗做個有利嘅特徵，令到隻蠖變得冇咁樣眼。
地球一路都有好多地殼活動、氣候同埋洋流等嘅嘢令地球嘅環境不斷噉變化，而呢啲變化令到地球上嘅生物要係噉進化嚟適應新環境，亦都令地球嘅生物多樣性（biodiversity）變得更加高[49]。
運算模擬
物競天擇可以大致上噉用以下嘅JavaScript碼嚟模擬[50]：
varp;//基因P喺個族群當中嘅出現率
varN=2000;
vargenerations=200;
vardata=[];
varsimulations=10;
//定義咗柞子程序先。
functionnext_generation(simulation_data){//呢個子程序負責由一代嘅數據計下一代嘅樣
vardraws=2*N;
varA1=0;
varA2=0;
for(vari=0;i
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