堪稱造物主再世的生物編輯技術- CRISPR 與RNA 基因編輯
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另一項宛如魔術般的研究成果則是發現了特殊的編輯蛋白Cas13bt,小巧的體積能夠裝載進腺相關病毒,再順利傳送進入生物體內。
將Cas13 蛋白應用於RNA 編輯 ...
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基因線上票選2021年度精選3大技術,主題涵蓋mRNA技術、基因編輯、以及細胞療法。
本篇介紹生醫領域備受矚目的CRISPR、RNA基因編輯技術,不但帶來根治罕見疾病ATTR的一線曙光,也將持續擴展全球基因治療市場。
CRISPR基因編輯技術再升級,縮小編輯蛋白體積、提高編輯的精準度
透過人體內原本的PEG10蛋白提高RNA運送效率、宛如魔術地將大體積的Cas13 編輯蛋白裝載進腺病毒、來自古菌的迷你編輯蛋白,以及RNA編輯,保持低脫靶效應的同時,大大提升的編輯的精準度。
雖然諾貝爾獎的桂冠尚未青睞麻省理工學院的張鋒教授,但他在基因編輯技術CRISPR的重要成就,屢屢獲得國際期刊的肯定。
張鋒研究團隊8月20日發表於《Nature》研究,提出了一項傳送RNA分子的新技術-SEND(SelectiveEndogenouseNcapsidationforcellularDelivery),透過名為PEG10的保護蛋白包覆mRNA,並將能辨識的mRNA序列標記在目標mRNA上,並以細胞融合蛋白(fusogen)修飾,使RNA能夠和目標基因更精準結合。
重要的是,PEG10為人體本身存在的蛋白,不易引發免疫反應,可提高RNA運送效率。
另一項宛如魔術般的研究成果則是發現了特殊的編輯蛋白Cas13bt,小巧的體積能夠裝載進腺相關病毒,再順利傳送進入生物體內。
將Cas13蛋白應用於RNA編輯不但能維持RNA編輯的低脫靶效應,未來在RNA療法領域也能作為給藥的傳遞工具。
延伸閱讀:基因剪刀CRISPR並非萬能!臨床應用仍有困境
改良的CasMINI編輯系統
史丹佛大學(StandfordUniversity)團隊則提出改良的CasMINI編輯系統,與一般CRISPR系統中Cas9或Cas12a相比,CasMINI的胺基酸序列長度縮短了一半,更能精準傳送至目標細胞。
CasMINI運用的編輯蛋白Cas12f(Cas14)是從古菌(archaea)中分離出來的,該研究團隊透過電腦預測結合生物工程改造,選定改造位點,並且會將所帶有的綠色螢光蛋白(greenfluorescentprotein,GFP)嵌入目標細胞。
研究解果顯示,Cas12f編輯蛋白與CRISPR常運用的Cas12a的編輯效率相當,也改良單股導引RNA(single-guideRNA)的設計,能執行高精準度編輯並維持低脫靶效應。
CasMINI與Cas13b皆可裝載進腺相關病毒載體(adeno-associatedvirus,AAV),具有體積小、高精準編輯度的優勢,此外,CasMINImRNA也裝進奈米脂質顆粒中傳遞,對於mRNA疫苗或其他RNA技術的研發具有相當應用性。
根治ATTR的一線曙光
今年6月,IntelliaTherapeutics與再生元(RegeneronPharmaceuticlas)宣布完成全球第一個利用基因編輯技術 CRISPR的人體內臨床試驗。
該項第一期臨床試驗以NTLA-2001治療ATTR(遺傳性轉甲狀腺素澱粉樣病變)患者體內的致病蛋白質-錯誤折疊的轉甲狀腺素(TTR),結果顯示NTLA-2001大幅降低病患體內異常沈澱的TTR蛋白濃度,研究成果發表於《TheNewEnglandJournalofMedicine》。
目前遺傳性ATTR最普遍的療法為原位肝臟移植,其他用藥方面有ATTR的標準治療-Alnylam的Onpattro(FDA批准的第一個RNAi療法),Ionis的反義寡核苷酸抑制劑(antisenseoligonucleotideinhibitor)Tegsedi;而輝瑞的Vyndaqel和Vyndamax適用於ATTR-CM(由上述TTR基因突變引起),但皆需透過長期給藥,才可維持患者體內低濃度TTR。
NTLA-2001療法運用CRISPR-Cas9的基因編輯技術為基礎,讓突變的TTR基因失效,直接將基因編輯的治療輸送至病患肝臟,藉此降低患者體內TTR蛋白濃度。
若NTLA-2001獲核准,它將會成為第一個可根治ATTR的基因療法。
多虧了新冠疫情,打響了RNA的名號
RNAEditingvs.CRISPR
說起RNA編輯與CRISPR的比較,CRISPR運用的編輯蛋白Cas9來自於細菌,而且大部分CRISPR技術仍只能在體外進行。
相較之下,RNA編輯蛋白ADAR(AdenosinedeaminasesactingonRNA)天然存在許多生物體中,這意味著不需要外來切割蛋白的輔助之下就能執行RNA編輯的功能,這項特質也使得RNA編輯在相關療法的核准上更有優勢。
CRISPR的另一個劣勢為存在著脫靶效應(off-target)的隱憂,儘管RNA編輯也不能完全避免這個現象,但它不像DNA編輯會對基因組產生永久更動的嚴重影響。
另外相較DNA編輯在分化初期的細胞較有效,RNA編輯更適合在分裂期後(post-mitotic)細胞中作用,例如再生能力差的神經細胞。
RNA編輯勝出DNA基因治療的另一點,是能夠動態調節基因表現。
過往基因治療以組織、器官為單位,要調節單一基因表現難度很高,RNA編輯則能夠做到更彈性調節基因,也不用擔心基因過度表現(over-expression)或低度表現(under-expression)。
然而,RNA編輯發展不是毫無阻礙,隨著新興療法走向越來越體積小的治療途徑,RNA編輯也面臨到需要改善編輯系統大小的挑戰。
在我們讚嘆科學技術進步的同時,也展望未來這些編輯蛋白技術還有許多可以改良的空間。
接下來,基因線上也將介紹焦點生物技術:細胞療法,以及彙整年度IPO、M&A,與讀者回顧2021年國際生醫重要進展,請持續鎖定關注!
延伸閱讀:RNA編輯崛起,不再屈居CRISPR之下?專訪JoshuaRosenthal教授
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