韩国综合猪品种Woori-Heukdon 的全基因组评估,Frontiers in ...

韩国合成猪品种Woori-Heukdon (WRH; F3) 是通过将亲本品种（韩国本土猪[KNP] 和韩国杜洛克[DUC]）与其杂交种群（F1 和F2）杂交而开发的。

搜索 当前位置： X-MOL学术 › Front.Genet. › 论文详情 韩国综合猪品种Woori-Heukdon的全基因组评估 FrontiersinGenetics ( IF 4.772 ) PubDate : 2022-02-02 ,DOI: 10.3389/fgene.2022.779152 Yong-MinKim 1, 2 , Ha-SeungSeong 1, 2 , Young-SinKim 1 , Joon-KiHong 1 , Soo-JinSa 1 , JungjaeLee 3 , Jun-HeeLee 4 , Kyu-HoCho 1 , Won-HyongChung 5 , Jung-WooChoi 2 , Eun-SeokCho 1 Affiliation  SwineScienceDivision,NationalInstituteofAnimalScience,RuralDevelopmentAdministration,Cheonan,SouthKorea. DepartmentofAnimalScience,CollegeofAnimalLifeSciences,KangwonNationalUniversity,Chuncheon,SouthKorea. DepartmentofAnimalScienceandTechnology,CollegeofBiotechnologyandNaturalResources,Chung-AngUniversity,Anseong,SouthKorea. InstituteofAgricultureandLifeScience,CollegeofAgricultureandLifeSciences,GyeongsangNationalUniversity,Jinju,SouthKorea. ResearchGroupofHealthcare,KoreaFoodResearchInstitute,Wanju,SouthKorea. 韩国合成猪品种Woori-Heukdon(WRH;F3)是通过将亲本品种（韩国本土猪[KNP]和韩国杜洛克[DUC]）与其杂交种群（F1和F2）杂交而开发的。

这项全基因组研究使用IlluminaPorcineSNP60BeadChip评估了总共2,074头猪，其中包括杂交猪群和亲本猪群。

在对初始数据集进行质量控制后，我们进行了种群结构、遗传多样性和纯合性(ROH)分析。

种群结构分析表明，杂交种群在杂交方案中根据其世代阶段受到亲本品种的遗传影响。

此外，主成分分析显示WRH的分散集群，这可能反映了在前一个育种组中引入了一个新的育种组。

预期的杂合度值，用于评估遗传多样性的WRH、F2、F1、DUC和KNP分别为0.365、0.349、0.336、0.330和0.211。

基于ROH的近交系数在KNP(.409)中最高，其次是WRH(.186)、DUC(.178)、F2(.107)和F1(.035)。

此外，短ROH的频率随着交叉阶段（从F1到WRH）而降低。

或者，中长ROH的频率增加，这表明最近F2和WRH的近亲繁殖。

此外，可能从其亲本品种继承的WRH中ROH岛的基因注释揭示了几个有趣的候选基因，这些基因可能与猪的适应、肉质、生产和繁殖性状有关。

基于ROH的近交系数在KNP(.409)中最高，其次是WRH(.186)、DUC(.178)、F2(.107)和F1(.035)。

此外，短ROH的频率随着交叉阶段（从F1到WRH）而降低。

或者，中长ROH的频率增加，这表明最近F2和WRH的近亲繁殖。

此外，可能从其亲本品种继承的WRH中ROH岛的基因注释揭示了几个有趣的候选基因，这些基因可能与猪的适应、肉质、生产和繁殖性状有关。

基于ROH的近交系数在KNP(.409)中最高，其次是WRH(.186)、DUC(.178)、F2(.107)和F1(.035)。

此外，短ROH的频率随着交叉阶段（从F1到WRH）而降低。

或者，中长ROH的频率增加，这表明最近F2和WRH的近亲繁殖。

此外，可能从其亲本品种继承的WRH中ROH岛的基因注释揭示了几个有趣的候选基因，这些基因可能与猪的适应、肉质、生产和繁殖性状有关。

中长ROH的频率增加，这表明最近在F2和WRH中进行了近亲繁殖。

此外，可能从其亲本品种继承的WRH中ROH岛的基因注释揭示了几个有趣的候选基因，这些基因可能与猪的适应、肉质、生产和繁殖性状有关。

中长ROH的频率增加，这表明最近在F2和WRH中进行了近亲繁殖。

此外，可能从其亲本品种继承的WRH中ROH岛的基因注释揭示了几个有趣的候选基因，这些基因可能与猪的适应、肉质、生产和繁殖性状有关。

"点击查看英文标题和摘要" Genome-WideAssessmentofaKoreanCompositePigBreed,Woori-Heukdon AKoreansyntheticpigbreed,Woori-Heukdon(WRH;F3),wasdevelopedbycrossingparentalbreeds(Koreannativepig[KNP]andKoreanDuroc[DUC])withtheircrossbredpopulations(F1andF2).Thisstudyingenome-wideassessedatotalof2,074pigswhichincludethecrossbredandtheparentalpopulationsusingtheIlluminaPorcineSNP60BeadChip.Afterqualitycontroloftheinitialdatasets,weperformedpopulationstructure,geneticdiversity,andrunsofhomozygosity(ROH)analyses.Populationstructureanalysesshowedthatcrossbredpopulationsweregeneticallyinfluencedbytheparentalbreedsaccordingtotheirgenerationstageinthecrossbreedingscheme.Moreover,principalcomponentanalysisshowedthedispersedclusterofWRH,whichmightreflectintroducinganewbreedinggroupintothepreviousone.Expectedheterozygosityvalues,whichwereusedtoassessgeneticdiversity,were.365,.349,.336,.330,and.211forWRH,F2,F1,DUC,andKNP,respectively.TheinbreedingcoefficientbasedonROHwasthehighestinKNP(.409),followedbyWRH(.186),DUC(.178),F2(.107),andF1(.035).Moreover,thefrequencyofshortROHdecreasedaccordingtothecrossingstage(fromF1toWRH).Alternatively,thefrequencyofmediumandlongROHincreased,whichindicatedrecentinbreedinginF2andWRH.Furthermore,geneannotationoftheROHislandsinWRHthatmightbeinheritedfromtheirparentalbreedsrevealedseveralinterestingcandidategenesthatmaybeassociatedwithadaptation,meatquality,production,andreproductiontraitsinpigs. 更新日期：2022-02-02   点击分享   查看原文 点击收藏 取消收藏 新增笔记 公开下载 阅读更多本刊最新论文 本刊介绍/投稿指南 PDF    https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2022.779152/pdf 全部期刊列表>> 学术期刊 行业资讯 全球导师 X-MOL问答 求职广场 网址导航 关于我们 帮助中心 客服邮箱：[email protected] 官方微信：X-molTeam2 邮编：100098 地址：北京市海淀区知春路56号中航科技大厦          Copyright©2014-2022北京衮雪科技有限公司AllRightsReserved     京ICP备11026495-2号      京公网安备11010802027423号 down wechat bug bug